Для многих операционных систем на базе Debian есть возможность использовать Windows-версию среды через Wine

1. Если Wine не установлен, то установите его

sudo apt-get install wine

1. Скачайте Блэкбокс для Windows http://blackbox.oberon.org/download
2. Распакуйте в любом удобном месте на ПК (например ~/blackbox)
3. Сделайте директорию для ваших проектов (например ~/projects)
4. Добавьте в директорию ~/.local/share/nautilus/scripts файл с названием BlackBox и содержимым:

#!/bin/sh
wine $HOME'/blackbox/BlackBox.exe' /USE "`winepath -w "$PWD"`" $* &

Чтобы увидеть скрытые папки с точками в начале названия (.local), нажмите Ctrl+H в домашней директории.

Не забудьте установить права на выполнение этого скрипта через диалог свойств файла или через терминал:

chmod +x ~/.local/share/nautilus/scripts/BlackBox

После такой настройки BlackBox легко вызвать в любой директории с проектами из раздела Сценарии контекстного меню Nautilus. При этом контекстное меню надо вызывать не на пустом месте, а для папки или файла. Иначе в версиях Ubuntu начиная с 14.04 раздел сценариев недоступен.

Приятного использования!